Bhain na taighdeoirí úsáid as an bpíblíne nua um thóraíocht iseatóp cobhsaí ard-thréchuir (HT-SIP) agus meitigenomics chun an chéad fhéachaint a fháil ar an micribhithóim ghníomhach a bhaineann le planda tairbhiúil symbiont, fungais mhiocorrhiséalacha earbacha (AMF). Creidmheas: Saotharlann Náisiúnta Lawrence Livermore
Príomhaidhm ag micribhitheolaithe comhshaoil is ea céannacht miocróib fhiáine a nascadh lena dtréithe fiseolaíocha agus lena bhfeidhmeanna comhshaoil. De na teicníochtaí a dhéanann iarracht an sprioc seo a bhaint amach, meastar gurb é Stable Iseatóp Probing - SIP - an ceann is éifeachtaí chun staidéar a dhéanamh ar mhiocrorgánaigh ghníomhacha i suíomhanna nádúrtha.
Tá teicníocht nua forbartha ag eolaithe Saotharlainne Náisiúnta Lawrence Livermore (LLNL) - SIP ard-thréchuir - a uathoibríonn roinnt céimeanna sa phróiseas um iniúchadh iseatóp cobhsaí, a cheadaíonn imscrúduithe ar ghníomhaíocht mhiocróbach miocrorgánach faoi choinníollacha réalaíocha, gan gá le saothrú saotharlainne.
In SIP, sainaithnítear miocróib gníomhacha trí iseatóip chobhsaí a ionchorprú ina mbithmhais. Tá sé i measc na modhanna is cumhachtaí san éiceolaíocht mhiocróbach ós rud é gur féidir leis miocróib ghníomhacha agus a dtréithe fiseolaíocha a aithint (úsáid tsubstráit, bithcheimic cheallacha, meitibileacht, fás, básmhaireacht) i bpobail chasta faoi choinníollacha dúchais.
Go hiondúil, teastaíonn obair láimhe substaintiúil le modh SIP agus ní cheadaíonn sé ach do líon beag samplaí. Ach éilíonn an teicníc LLNL nua an séú cuid den mhéid saothair láimhe i gcomparáid leis an SIP láimhe agus ceadaítear 16 sampla a phróiseáil ag an am céanna.
“Laghdaíonn ár gcur chuige leath-uathoibríoch am oibreora agus feabhsaíonn sé in-atáirgtheacht trí dhíriú ar na céimeanna is déine ó thaobh saothair de SIP,” a dúirt an t-eolaí LLNL Erin Nuccio, agus príomhúdar páipéir atá le feiceáil san iris Microbiome. “Tá an cur chuige seo in úsáid againn anois chun breis is míle sampla a phróiseáil, lena n-áirítear roinnt ó mhicrea-ghnáthóga ithreach nach bhfuil mórán staidéir déanta orthu.”
Micrea-ghnáthóg amháin den sórt sin is ea an ithir atá díreach timpeall ar fhíocháin an mhiocorrhizae—cineál fungais a chruthaíonn caidreamh siombóiseach le 72% de na plandaí talún ar fad. Mar mhalairt ar charbón plandaí, soláthraíonn an fungas (fungais mhiocorrhiséalacha bolgánacha) a chuid óstaigh acmhainní riachtanacha amhail nítrigin, fosfar agus uisce.
Sa staidéar cruthúnais choincheapa seo, léirigh na húdair “gréasán bia” na n-idirghníomhaíochtaí spreagtha ag fungais mhiocorrhizal san ithir.
“Is dóigh linn gur bealach mór é seo chun carbón plandaí a dháileadh go forleathan san ithir. Tá an linn is mó de charbón orgánach ar an bplainéad ag rothaíocht go gníomhach san ithir,” a dúirt an t-údar comhfhreagraí Jennifer Pett-Ridge, atá ina ceannaire ar thionscadal LLNL agus ina ceannaire ar Limistéar Fócais Eolaíoch Micribhithóim na hIthreach “Microbes Persist” de chuid Oifig Eolaíochta na Roinne Fuinnimh. . “Chuireamar méid beag de DNA in ord, rinneamar na horgánaigh ghníomhacha a chinneadh agus ansin rinneamar a gcuid géanóim agus a n-idirghníomhaíochtaí féideartha a athchruthú.”
I measc na n-údair LLNL eile tá Steven Blazewicz, Marissa Lafler, Ashley Campbell, Jeffrey Kimbrel, Jessica Wollard, Rachel Hestrin chomh maith le taighdeoirí ó Saotharlann Náisiúnta Lawrence Berkeley, Institiúid Comhghéanóim an DOE agus Ollscoil California, Berkeley.